La pandemia da SARS-CoV-2 ha messo a dura prova il sistema sanitario nell’epicentro lombardo, in particolare durante la prima ondata del contagio sia a livello ospedaliero che territoriale. La risposta organizzativa del sistema è risultata difforme tra i due comparti, che hanno dovuto affrontare e risolvere il dilemma della complessità di fronte alla grave perturbazione rappresentata dal “cigno nero” pandemico. L’articolo analizza le diverse modalità messe in atto dai due settori sanitari utilizzando la chiave interpretativa della complessità e dei concetti di resilienza, difesa del nucleo tecnico, approccio generalista e differenziazione funzionale specialistica.